Динамика конформационной координаты

Изменение конформационной координаты канала Q можно описать с помощью уравнения Ланжевена [105]:

(2.7)

где M – параметр эффективной массы RyR-канала (для упрощения принимается М =1);

– переменная, описывающая электронное состояние канала ( – электронно-закрытое, и – электронно-открытое); – параметр конформационного «трения» (параметр диссипации); – сила случайных температурных флуктуаций в конформационной динамике RyR-канала.

Если пренебречь случайными тепловыми флуктуациями (), то уравнение Ланжевена является вторым законом Ньютона. В этом случае (2.5) описывает процессы релаксации конформационной координаты по ветвям конформационного потенциала к их минимумам: – для электронно-закрытого, – для электронно-открытого канала (рис.2.2).